More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4961 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
586 aa  1205    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  40.75 
 
 
544 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.97 
 
 
537 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.97 
 
 
537 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.79 
 
 
537 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.97 
 
 
537 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.15 
 
 
537 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.79 
 
 
537 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.97 
 
 
537 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.79 
 
 
537 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.79 
 
 
537 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 
539 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 
537 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  41.52 
 
 
540 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.46 
 
 
546 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 
547 aa  358  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 
542 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 
560 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.32 
 
 
550 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.88 
 
 
546 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 
533 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  40.93 
 
 
546 aa  346  8e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.75 
 
 
560 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.04 
 
 
560 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.93 
 
 
545 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 
550 aa  343  5.999999999999999e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 
548 aa  342  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.92 
 
 
560 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.5 
 
 
560 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.14 
 
 
548 aa  339  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.74 
 
 
560 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.92 
 
 
560 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
546 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 
551 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 
549 aa  333  6e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.39 
 
 
560 aa  333  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.87 
 
 
560 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
544 aa  332  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  34.7 
 
 
546 aa  331  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 
549 aa  331  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 
551 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 
548 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.37 
 
 
534 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 
563 aa  330  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2639  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.46 
 
 
480 aa  329  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.47 
 
 
560 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 
547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
546 aa  327  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 
546 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 
537 aa  327  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.19 
 
 
541 aa  327  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.4 
 
 
558 aa  327  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
548 aa  326  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 
553 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 
544 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 
546 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.48 
 
 
545 aa  323  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 
553 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.5 
 
 
548 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.12 
 
 
546 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.12 
 
 
546 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
549 aa  323  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 
549 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.78 
 
 
548 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.77 
 
 
536 aa  321  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.39 
 
 
548 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4934  putative acyl-CoA synthetase  34.82 
 
 
542 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  35.42 
 
 
542 aa  320  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.17 
 
 
543 aa  320  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  34.35 
 
 
542 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.57 
 
 
545 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.69 
 
 
543 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.69 
 
 
543 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 
557 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.69 
 
 
543 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 
535 aa  317  5e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 
552 aa  316  8e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 
547 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.26 
 
 
545 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  34.58 
 
 
564 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.65 
 
 
542 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.47 
 
 
542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5305  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.05 
 
 
549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  34.58 
 
 
542 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  34.35 
 
 
534 aa  312  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2733  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 
542 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 
564 aa  311  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 
538 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4392  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 
542 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 
550 aa  310  4e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 
545 aa  310  5.9999999999999995e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0471179  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 
542 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.86 
 
 
541 aa  310  6.999999999999999e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 
527 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8848  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 
541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.44 
 
 
545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 
546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 
542 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 
584 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>