More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7172 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  62.31 
 
 		 601 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.14 
 
 		 601 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  64.64 
 
 		 548 aa  756    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.97 
 
 		 601 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 553 aa  1137    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.14 
 
 		 601 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.14 
 
 		 601 aa  707    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  64.02 
 
 		 548 aa  747    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.14 
 
 		 601 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  58.61 
 
 		 547 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.56 
 
 		 552 aa  570  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  55.62 
 
 		 554 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  55.13 
 
 		 555 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  54.95 
 
 		 559 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  54.95 
 
 		 559 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.75 
 
 		 545 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  51.21 
 
 		 546 aa  554  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.92 
 
 		 550 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  52.96 
 
 		 546 aa  551  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.99 
 
 		 548 aa  548  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.63 
 
 		 548 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  49.17 
 
 		 556 aa  543  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.84 
 
 		 560 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.07 
 
 		 560 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.2 
 
 		 560 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.02 
 
 		 560 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.47 
 
 		 548 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.11 
 
 		 560 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.93 
 
 		 560 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.02 
 
 		 560 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.92 
 
 		 560 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.93 
 
 		 560 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 560 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.06 
 
 		 546 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  51.29 
 
 		 546 aa  524  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.26 
 
 		 548 aa  518  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.69 
 
 		 546 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  45.21 
 
 		 564 aa  512  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  45.37 
 
 		 564 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  47.27 
 
 		 556 aa  503  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  48.08 
 
 		 556 aa  500  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.4 
 
 		 545 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  46.21 
 
 		 563 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  41.74 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 		 537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 		 548 aa  369  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 		 544 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 546 aa  362  1e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 		 547 aa  355  2e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 552 aa  347  2e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 546 aa  348  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.6 
 
 		 536 aa  345  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 544 aa  342  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35 
 
 		 537 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.81 
 
 		 537 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.81 
 
 		 537 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 537 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 542 aa  337  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 575 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.63 
 
 		 537 aa  335  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 		 546 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4358  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 		 549 aa  334  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.124731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 537 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.63 
 
 		 537 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 		 537 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 		 537 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 552 aa  332  1e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 		 557 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0380  putative acyl-CoA synthetase  36.68 
 
 		 545 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.9 
 
 		 543 aa  331  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 		 539 aa  329  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1165  putative acyl-CoA synthetase  34.69 
 
 		 542 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431504  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3973  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 		 545 aa  327  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 549 aa  326  7e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.2 
 
 		 546 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5305  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.68 
 
 		 549 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.2 
 
 		 546 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.2 
 
 		 546 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 		 527 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 586 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  35.37 
 
 		 534 aa  323  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2557  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 555 aa  323  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.69 
 
 		 541 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 544 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 533 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  34.5 
 
 		 542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.86 
 
 		 558 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.87 
 
 		 542 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2922  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 		 554 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.933467  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  34.26 
 
 		 542 aa  319  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 558 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 549 aa  319  9e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 543 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0444  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 542 aa  319  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.9 
 
 		 543 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>