More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0619 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
546 aa  1103    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  57.66 
 
 
546 aa  621  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  56.17 
 
 
547 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  57.12 
 
 
555 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  57.12 
 
 
559 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  56.93 
 
 
559 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  52.51 
 
 
546 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  55.29 
 
 
554 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.67 
 
 
545 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.61 
 
 
552 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  51.29 
 
 
553 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.99 
 
 
560 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.93 
 
 
560 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.61 
 
 
560 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  50.83 
 
 
548 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.43 
 
 
560 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.26 
 
 
545 aa  538  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.33 
 
 
550 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.24 
 
 
560 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.43 
 
 
548 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.22 
 
 
560 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  50.47 
 
 
548 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.03 
 
 
560 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.35 
 
 
546 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.95 
 
 
548 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.13 
 
 
548 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.43 
 
 
546 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.66 
 
 
560 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.28 
 
 
601 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.28 
 
 
601 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.28 
 
 
560 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.28 
 
 
601 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.22 
 
 
560 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.28 
 
 
601 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  48.46 
 
 
563 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  48.28 
 
 
601 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.1 
 
 
601 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  45.54 
 
 
564 aa  495  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  44.83 
 
 
564 aa  491  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.13 
 
 
548 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  44.95 
 
 
556 aa  488  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  44.28 
 
 
556 aa  462  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  44.2 
 
 
556 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 
535 aa  431  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  43.24 
 
 
546 aa  413  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  42.1 
 
 
547 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 
537 aa  411  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 
548 aa  411  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  42.66 
 
 
527 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  42.15 
 
 
544 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
552 aa  356  5.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 
558 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 
549 aa  342  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 
557 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.08 
 
 
543 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.08 
 
 
543 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.08 
 
 
543 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0905  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 
547 aa  335  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2557  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 
555 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  41.03 
 
 
552 aa  334  3e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.06 
 
 
537 aa  332  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.29 
 
 
537 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.29 
 
 
537 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.29 
 
 
537 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 
575 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 
537 aa  330  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 
550 aa  329  9e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.92 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.92 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.92 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  41.09 
 
 
538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.92 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.92 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.01 
 
 
546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 
544 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 
542 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.81 
 
 
546 aa  327  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.81 
 
 
546 aa  327  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 
539 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.14 
 
 
536 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 
533 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 
537 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 
565 aa  325  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 
530 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 
553 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 
540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 
550 aa  320  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 
542 aa  319  7e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3973  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.2 
 
 
545 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.45 
 
 
546 aa  317  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.916006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 
531 aa  316  7e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4358  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39 
 
 
549 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.124731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 
543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 
544 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  36 
 
 
546 aa  313  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2922  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
554 aa  312  9e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.933467  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.8 
 
 
543 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 
586 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.7 
 
 
545 aa  311  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 
546 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>