More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0896 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.28 
 
 
550 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.68 
 
 
545 aa  674    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60 
 
 
548 aa  643    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
552 aa  1142    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.56 
 
 
548 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  61.78 
 
 
546 aa  667    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.81 
 
 
548 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  59.14 
 
 
547 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  57.46 
 
 
546 aa  630  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  57.76 
 
 
554 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.06 
 
 
545 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  55.78 
 
 
555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.48 
 
 
560 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.85 
 
 
560 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  52.01 
 
 
548 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.66 
 
 
560 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  55.41 
 
 
559 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.84 
 
 
560 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.71 
 
 
548 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.12 
 
 
546 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  50.73 
 
 
548 aa  594  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  55.22 
 
 
559 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  51.56 
 
 
553 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.66 
 
 
560 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.11 
 
 
560 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.25 
 
 
560 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.3 
 
 
560 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.72 
 
 
546 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.46 
 
 
560 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  52.6 
 
 
556 aa  568  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.25 
 
 
560 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  52.61 
 
 
546 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  49.27 
 
 
564 aa  542  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  49.73 
 
 
563 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  51.37 
 
 
556 aa  535  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  49.09 
 
 
564 aa  537  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  51.19 
 
 
556 aa  538  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.53 
 
 
601 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  45.7 
 
 
601 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.53 
 
 
601 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.53 
 
 
601 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.53 
 
 
601 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.36 
 
 
601 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  40.82 
 
 
535 aa  425  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
537 aa  412  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 
544 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  40.69 
 
 
548 aa  397  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 
547 aa  387  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  40.74 
 
 
546 aa  385  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
553 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 
542 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.1 
 
 
537 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
537 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.91 
 
 
537 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 
533 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.98 
 
 
537 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 
558 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 
537 aa  353  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 
537 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 
537 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.42 
 
 
537 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 
537 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.42 
 
 
537 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 
549 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 
540 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 
552 aa  345  2e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 
557 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.22 
 
 
545 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 
539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.27 
 
 
546 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.88 
 
 
543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.88 
 
 
543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.88 
 
 
543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.5 
 
 
541 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 
546 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 
546 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 
543 aa  337  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.5 
 
 
545 aa  336  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 
575 aa  335  9e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 
546 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
546 aa  335  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 
544 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0905  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 
547 aa  333  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.99 
 
 
536 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2557  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
555 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.72 
 
 
545 aa  331  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 
550 aa  329  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.33 
 
 
545 aa  329  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.13 
 
 
534 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 
549 aa  326  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  39 
 
 
538 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5305  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.35 
 
 
549 aa  324  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0328  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 
540 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1027  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.74 
 
 
560 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729958  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.81 
 
 
543 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
542 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.31 
 
 
547 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 
586 aa  323  7e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 
552 aa  322  8e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>