53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1820 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1820  DEAD-like helicases-like protein  100 
 
 		 978 aa  2037    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3240  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  62.05 
 
 		 1126 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3376  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  94.62 
 
 		 1126 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110727 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0051  hypothetical protein  49.4 
 
 		 1131 aa  158  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2838  hypothetical protein  49.4 
 
 		 1131 aa  158  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2448  CRISPR-associated helicase Cas3 family  58.16 
 
 		 1122 aa  134  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.416428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0488  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  59.18 
 
 		 1178 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1459  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  38.16 
 
 		 1167 aa  130  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00343785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33340  helicase  53.06 
 
 		 1076 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0697  CRISPR-associated helicase Cas3 family  39.16 
 
 		 1093 aa  125  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000756095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1645  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  53.06 
 
 		 1095 aa  125  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  53.06 
 
 		 1095 aa  124  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3658  CRISPR-associated helicase Cas3 family  36.36 
 
 		 1096 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0733  CRISPR-associated helicase Cas3 family  37.95 
 
 		 1095 aa  121  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1402  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  35.33 
 
 		 1072 aa  110  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.23535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2750  helicases-like  41.86 
 
 		 1166 aa  89.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0177005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  23.34 
 
 		 1027 aa  70.1  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  23.75 
 
 		 729 aa  62  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.57 
 
 		 736 aa  61.2  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  22.32 
 
 		 799 aa  61.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  23.77 
 
 		 750 aa  59.7  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  25.4 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  21.07 
 
 		 763 aa  57.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  24.19 
 
 		 778 aa  57.4  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  23.67 
 
 		 811 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  22.65 
 
 		 823 aa  54.7  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.08 
 
 		 492 aa  54.3  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  24.39 
 
 		 750 aa  53.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  31.78 
 
 		 594 aa  52.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  30.19 
 
 		 921 aa  52.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  31.78 
 
 		 860 aa  52  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  23.91 
 
 		 764 aa  50.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.19 
 
 		 775 aa  50.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  23.56 
 
 		 726 aa  49.7  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  30.19 
 
 		 915 aa  49.3  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  22.36 
 
 		 737 aa  49.3  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.66 
 
 		 897 aa  48.5  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  23.22 
 
 		 929 aa  48.1  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  30.83 
 
 		 854 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  25.14 
 
 		 944 aa  47.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  21.52 
 
 		 827 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  26.85 
 
 		 832 aa  47  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  21.49 
 
 		 917 aa  46.2  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  20.11 
 
 		 801 aa  46.2  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  26.73 
 
 		 854 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  30 
 
 		 908 aa  45.8  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  25.11 
 
 		 744 aa  45.8  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  24.55 
 
 		 922 aa  45.4  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  25.44 
 
 		 887 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  25.58 
 
 		 888 aa  45.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  25.58 
 
 		 888 aa  45.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.56 
 
 		 885 aa  44.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  28.57 
 
 		 857 aa  44.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>