22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0733 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3376  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  49.52 
 
 		 1126 aa  1007    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2448  CRISPR-associated helicase Cas3 family  46.19 
 
 		 1122 aa  901    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.416428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3658  CRISPR-associated helicase Cas3 family  72.18 
 
 		 1096 aa  1623    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0697  CRISPR-associated helicase Cas3 family  85.94 
 
 		 1093 aa  1899    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000756095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0733  CRISPR-associated helicase Cas3 family  100 
 
 		 1095 aa  2250    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1645  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  58.9 
 
 		 1095 aa  1278    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  58.81 
 
 		 1095 aa  1277    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3240  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  49.52 
 
 		 1126 aa  1007    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1402  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  54.48 
 
 		 1072 aa  1118    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.23535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1459  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  43.04 
 
 		 1167 aa  760    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00343785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0488  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  44.5 
 
 		 1178 aa  787    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33340  helicase  49.18 
 
 		 1076 aa  962    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278581 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2838  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1131 aa  572  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0051  hypothetical protein  35.49 
 
 		 1131 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2750  helicases-like  34.31 
 
 		 1166 aa  320  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0177005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1820  DEAD-like helicases-like protein  37.95 
 
 		 978 aa  121  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  25.06 
 
 		 929 aa  52.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  22.46 
 
 		 944 aa  50.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  25.57 
 
 		 919 aa  50.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  22.82 
 
 		 832 aa  48.9  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  23.72 
 
 		 915 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  23.72 
 
 		 775 aa  46.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>