21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3376 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2448  CRISPR-associated helicase Cas3 family  43.53 
 
 		 1122 aa  769    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.416428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33340  helicase  41.92 
 
 		 1076 aa  789    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0488  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  39.64 
 
 		 1178 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1459  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  36.63 
 
 		 1167 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00343785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1402  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  46.04 
 
 		 1072 aa  904    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.23535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3658  CRISPR-associated helicase Cas3 family  48.9 
 
 		 1096 aa  965    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3240  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  99.64 
 
 		 1126 aa  2335    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  48.68 
 
 		 1095 aa  999    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0697  CRISPR-associated helicase Cas3 family  50.35 
 
 		 1093 aa  1003    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000756095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3376  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  100 
 
 		 1126 aa  2343    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1645  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  48.68 
 
 		 1095 aa  998    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0733  CRISPR-associated helicase Cas3 family  49.52 
 
 		 1095 aa  1007    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0051  hypothetical protein  38.59 
 
 		 1131 aa  582  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2838  hypothetical protein  38.19 
 
 		 1131 aa  572  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2750  helicases-like  30.56 
 
 		 1166 aa  357  5.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0177005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1820  DEAD-like helicases-like protein  94.62 
 
 		 978 aa  190  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  24.27 
 
 		 929 aa  52  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  21.18 
 
 		 919 aa  52  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  36.51 
 
 		 737 aa  47.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  33.33 
 
 		 762 aa  45.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  32.93 
 
 		 807 aa  45.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>