19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2838 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2838  hypothetical protein  100 
 
 		 1131 aa  2353    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0051  hypothetical protein  97.7 
 
 		 1131 aa  2302    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2448  CRISPR-associated helicase Cas3 family  34.57 
 
 		 1122 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.416428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33340  helicase  36.47 
 
 		 1076 aa  612  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3658  CRISPR-associated helicase Cas3 family  36.76 
 
 		 1096 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0697  CRISPR-associated helicase Cas3 family  35.44 
 
 		 1093 aa  589  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000756095  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  35.41 
 
 		 1095 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1645  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  35.41 
 
 		 1095 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3240  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  38.19 
 
 		 1126 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3376  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  38.19 
 
 		 1126 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0733  CRISPR-associated helicase Cas3 family  35.79 
 
 		 1095 aa  572  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1459  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  34.07 
 
 		 1167 aa  567  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00343785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0488  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  33.82 
 
 		 1178 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1402  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  32.76 
 
 		 1072 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.23535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2750  helicases-like  29.36 
 
 		 1166 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0177005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1820  DEAD-like helicases-like protein  49.4 
 
 		 978 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  25.31 
 
 		 929 aa  61.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  34.09 
 
 		 763 aa  46.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  23.32 
 
 		 701 aa  45.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>