18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2750 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2750  helicases-like  100 
 
 		 1166 aa  2421    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0177005  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0051  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1131 aa  386  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2838  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1131 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33340  helicase  31.07 
 
 		 1076 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3658  CRISPR-associated helicase Cas3 family  31.4 
 
 		 1096 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3240  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  30.63 
 
 		 1126 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3376  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  30.56 
 
 		 1126 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1645  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  29.17 
 
 		 1095 aa  361  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  29.17 
 
 		 1095 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2448  CRISPR-associated helicase Cas3 family  30.79 
 
 		 1122 aa  357  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.416428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1402  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  29.2 
 
 		 1072 aa  326  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.23535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0733  CRISPR-associated helicase Cas3 family  34.31 
 
 		 1095 aa  320  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0697  CRISPR-associated helicase Cas3 family  32.4 
 
 		 1093 aa  320  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000756095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1459  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  29.96 
 
 		 1167 aa  318  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00343785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0488  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  30.48 
 
 		 1178 aa  270  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1820  DEAD-like helicases-like protein  41.86 
 
 		 978 aa  89  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.57 
 
 		 775 aa  51.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  34.15 
 
 		 778 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>