25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1536 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2448  CRISPR-associated helicase Cas3 family  44.81 
 
 		 1122 aa  911    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.416428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3658  CRISPR-associated helicase Cas3 family  58.88 
 
 		 1096 aa  1266    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0697  CRISPR-associated helicase Cas3 family  58.36 
 
 		 1093 aa  1269    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000756095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0733  CRISPR-associated helicase Cas3 family  58.81 
 
 		 1095 aa  1277    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33340  helicase  46.87 
 
 		 1076 aa  922    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0488  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  44.4 
 
 		 1178 aa  795    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1459  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  41.66 
 
 		 1167 aa  790    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00343785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1402  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  54.96 
 
 		 1072 aa  1126    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.23535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1645  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  99.09 
 
 		 1095 aa  2256    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3376  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  48.68 
 
 		 1126 aa  999    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 1095 aa  2276    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3240  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  48.59 
 
 		 1126 aa  994    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0051  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1131 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2838  hypothetical protein  35.41 
 
 		 1131 aa  585  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2750  helicases-like  29.81 
 
 		 1166 aa  280  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0177005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1820  DEAD-like helicases-like protein  53.06 
 
 		 978 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  25.9 
 
 		 919 aa  56.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  24.05 
 
 		 917 aa  52.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  24.47 
 
 		 701 aa  50.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  24.57 
 
 		 832 aa  49.3  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  35.87 
 
 		 929 aa  48.5  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  25.89 
 
 		 892 aa  48.5  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.71 
 
 		 897 aa  46.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23.24 
 
 		 971 aa  45.8  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  27.96 
 
 		 912 aa  45.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>