24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3376  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  41.92 
 
 		 1126 aa  807    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2448  CRISPR-associated helicase Cas3 family  52.76 
 
 		 1122 aa  1065    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.416428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3658  CRISPR-associated helicase Cas3 family  47.38 
 
 		 1096 aa  953    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0697  CRISPR-associated helicase Cas3 family  49.64 
 
 		 1093 aa  967    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000756095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0733  CRISPR-associated helicase Cas3 family  49.18 
 
 		 1095 aa  981    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1645  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  46.87 
 
 		 1095 aa  942    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  46.87 
 
 		 1095 aa  941    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3240  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  41.83 
 
 		 1126 aa  803    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1402  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  45.28 
 
 		 1072 aa  882    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.23535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1459  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  47.03 
 
 		 1167 aa  884    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00343785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0488  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  47.73 
 
 		 1178 aa  898    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33340  helicase  100 
 
 		 1076 aa  2180    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278581 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2838  hypothetical protein  36.47 
 
 		 1131 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0051  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1131 aa  632  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2750  helicases-like  31.92 
 
 		 1166 aa  386  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0177005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1820  DEAD-like helicases-like protein  53.06 
 
 		 978 aa  126  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  25.82 
 
 		 897 aa  49.3  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  24.48 
 
 		 929 aa  48.5  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  28.19 
 
 		 922 aa  47.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  36.59 
 
 		 778 aa  47.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  36.63 
 
 		 918 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  32.67 
 
 		 944 aa  47.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  23.32 
 
 		 919 aa  46.2  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  37.7 
 
 		 887 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>