22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1402 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3240  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  45.86 
 
 
1126 aa  939    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2448  CRISPR-associated helicase Cas3 family  43.68 
 
 
1122 aa  853    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.416428  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3658  CRISPR-associated helicase Cas3 family  54.44 
 
 
1096 aa  1166    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0697  CRISPR-associated helicase Cas3 family  54.86 
 
 
1093 aa  1154    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000756095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0733  CRISPR-associated helicase Cas3 family  54.48 
 
 
1095 aa  1156    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1645  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  55.14 
 
 
1095 aa  1161    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3376  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  46.04 
 
 
1126 aa  941    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  54.96 
 
 
1095 aa  1163    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1402  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  100 
 
 
1072 aa  2225    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.23535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1459  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  39.48 
 
 
1167 aa  708    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00343785  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0488  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein  41.16 
 
 
1178 aa  745    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33340  helicase  45.51 
 
 
1076 aa  895    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0278581 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0051  hypothetical protein  33.22 
 
 
1131 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2838  hypothetical protein  32.87 
 
 
1131 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2750  helicases-like  30.69 
 
 
1166 aa  266  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0177005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1820  DEAD-like helicases-like protein  35.33 
 
 
978 aa  110  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  25.37 
 
 
917 aa  54.3  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  21.81 
 
 
912 aa  50.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  24.58 
 
 
927 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  22.58 
 
 
929 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  24.55 
 
 
944 aa  45.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.24 
 
 
971 aa  44.7  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>