50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0254 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  848    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  79.62 
 
 		 406 aa  681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  72.66 
 
 		 406 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  75.3 
 
 		 404 aa  615  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  53.44 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  50.97 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  49.88 
 
 		 408 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  53.44 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  45.52 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  44.1 
 
 		 403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  37.62 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  39.94 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  38.31 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  40 
 
 		 441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  36.39 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  36.39 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  36.66 
 
 		 378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  35.66 
 
 		 375 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  35.66 
 
 		 375 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  36.41 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  36.14 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  35.75 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  34.96 
 
 		 377 aa  206  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  35.77 
 
 		 374 aa  206  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  35.5 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  34.15 
 
 		 375 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  34.5 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  34.15 
 
 		 377 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  34.77 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  31.03 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  33.42 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  31.06 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  30.96 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  32.57 
 
 		 407 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  27.9 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  29.18 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  30.22 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  31.79 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  28.65 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  23.28 
 
 		 449 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.61 
 
 		 449 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  23.61 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  20.88 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  24.34 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  24.03 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1910  hypothetical protein  26.67 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4035  phosphate-selective porin O and P  23.26 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  24.35 
 
 		 358 aa  43.5  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3788  phosphate-selective porin O and P  22.03 
 
 		 395 aa  43.5  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000264942  decreased coverage  0.00000068158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>