48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2682 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  81.96 
 
 		 379 aa  664    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  83.24 
 
 		 377 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  773    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  76.66 
 
 		 377 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  76.39 
 
 		 377 aa  621  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  74.01 
 
 		 377 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  74.01 
 
 		 377 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  72.82 
 
 		 379 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  74.8 
 
 		 378 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  71.47 
 
 		 375 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  69.44 
 
 		 374 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  70.13 
 
 		 385 aa  554  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  65.95 
 
 		 375 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  64.1 
 
 		 391 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  63.99 
 
 		 375 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  63.99 
 
 		 375 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  65.92 
 
 		 375 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  55.4 
 
 		 372 aa  431  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  46.79 
 
 		 365 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  39.71 
 
 		 357 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  38.34 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  34.89 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  33.24 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  32.6 
 
 		 406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  34.6 
 
 		 450 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  34.51 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  32.78 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  31.51 
 
 		 406 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  31.71 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  33.51 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  33.24 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  30.67 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  30.33 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  29.79 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  30.59 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  30.22 
 
 		 446 aa  149  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  29.13 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  27.2 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  25.78 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  25 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  25.68 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  24.47 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  24.77 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  23.56 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.56 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  23.37 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1910  hypothetical protein  25.52 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>