46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0144 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  854    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  43.97 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  31.45 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  30.59 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  29.17 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  30.21 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  29.95 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  28.49 
 
 		 377 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  28.88 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  26.98 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  29.07 
 
 		 377 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  28.27 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  29.49 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  29 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  28.46 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  29.13 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  30.13 
 
 		 385 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  29.47 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  28.84 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  28.84 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  28.88 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  29.79 
 
 		 367 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  29.14 
 
 		 375 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  27.37 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  27.94 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  28.15 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  28.69 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  27.18 
 
 		 438 aa  136  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  28.1 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  27.72 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  26.98 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  28.99 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  27.73 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  27.54 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  28.68 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  28.18 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  27.37 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  28 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  25.46 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  25.58 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  25.58 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  26.49 
 
 		 449 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  26.25 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  26.52 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  25.68 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  26.6 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>