47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2536 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  84.92 
 
 		 377 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  87.57 
 
 		 377 aa  695    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  774    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  94.71 
 
 		 377 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  82.85 
 
 		 379 aa  664    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  80.97 
 
 		 374 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  94.18 
 
 		 377 aa  730    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  78.31 
 
 		 375 aa  621  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  74.8 
 
 		 375 aa  610  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  73.54 
 
 		 379 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  76.94 
 
 		 385 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  72.49 
 
 		 377 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  69.39 
 
 		 391 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  70.54 
 
 		 375 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  68.11 
 
 		 375 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  68.11 
 
 		 375 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  68.47 
 
 		 375 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  57.26 
 
 		 372 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  47.57 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  39.78 
 
 		 357 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  37.01 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  37.57 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  36.66 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  36.24 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  35.15 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  37.13 
 
 		 450 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  35.13 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  32.99 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  33.06 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  33.98 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  35.05 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  35.05 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  33.69 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  31.73 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  31.62 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  31.66 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  28.34 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  28.05 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  28.71 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  25 
 
 		 449 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  23.76 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  22.51 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  24.6 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  23.94 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.67 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  24.57 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>