47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00600 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  771    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  38.01 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  32.91 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  32.43 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  33.07 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  33.24 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  33.42 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  33.16 
 
 		 385 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  32.63 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  33.42 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  32.14 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  33.53 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  32.55 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  32.55 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  31.38 
 
 		 377 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  32.81 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  32.51 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  30.33 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  32.43 
 
 		 375 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  30.75 
 
 		 379 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  33.16 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  33.06 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  31.52 
 
 		 374 aa  155  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  33.24 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  31.18 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  31.84 
 
 		 450 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  30.58 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  31.51 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  30.21 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  31.15 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  29.92 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  32.17 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  30.62 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  28.77 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  29.64 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  28.69 
 
 		 446 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  28.57 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  26.84 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  26.1 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  24.06 
 
 		 446 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  23.83 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  23.83 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.83 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  23.6 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  23.64 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1910  hypothetical protein  26.59 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>