46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1648 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  888    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  33.42 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  31.06 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  31.62 
 
 		 378 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  30.77 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  32.64 
 
 		 375 aa  166  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  29.59 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  32.81 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  32.81 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  27.79 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  27.59 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  32.51 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  32.6 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  30.94 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  30.94 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  30.54 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  30.59 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  30.29 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  30.43 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  31.18 
 
 		 379 aa  150  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  28.47 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  26.29 
 
 		 406 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  28.06 
 
 		 403 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  27.29 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  26.71 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  28.89 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  30.81 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  29.59 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  28.3 
 
 		 365 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  26.9 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  27.75 
 
 		 408 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  29.19 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  27.75 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  25.71 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  28.96 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  28.57 
 
 		 372 aa  107  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  25.35 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  25.57 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  26.16 
 
 		 357 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  24.81 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  21.81 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  22.68 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  22.97 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.35 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  22.97 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>