48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0323 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  82.85 
 
 		 378 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  83.38 
 
 		 377 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  781    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  86.54 
 
 		 377 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  83.38 
 
 		 377 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  82.85 
 
 		 377 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  76.78 
 
 		 375 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  75.2 
 
 		 374 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  73.09 
 
 		 379 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  72.82 
 
 		 375 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  73.25 
 
 		 385 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  70.98 
 
 		 377 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  69.97 
 
 		 375 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  67.73 
 
 		 391 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  66.84 
 
 		 375 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  66.84 
 
 		 375 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  67.79 
 
 		 375 aa  510  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  59.4 
 
 		 372 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  46.7 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  39.16 
 
 		 396 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  40.62 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  37.33 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  35.75 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  35.97 
 
 		 406 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  36.31 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  36.67 
 
 		 367 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  37.63 
 
 		 450 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  35.31 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  36.92 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  35.52 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  36.26 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  34.97 
 
 		 408 aa  179  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  34.43 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  33.24 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  33.16 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  31.04 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  30.54 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  29.47 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  28.69 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  28.78 
 
 		 407 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  24.2 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  24.29 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  22.51 
 
 		 446 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  23.48 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  23.61 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.22 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  24.75 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1910  hypothetical protein  22.91 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>