47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3533 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  767    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  89.87 
 
 		 391 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  88 
 
 		 375 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  88 
 
 		 375 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  77.56 
 
 		 375 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  71.08 
 
 		 377 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  71.89 
 
 		 377 aa  559  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  68.8 
 
 		 375 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  72.65 
 
 		 378 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  70.27 
 
 		 377 aa  549  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  69.73 
 
 		 377 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  69.97 
 
 		 379 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  65.78 
 
 		 377 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  65.95 
 
 		 375 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  66.22 
 
 		 374 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  64.44 
 
 		 379 aa  524  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  66.32 
 
 		 385 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  54.84 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  47.31 
 
 		 365 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  40.9 
 
 		 357 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  38.42 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  36.39 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  38.32 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  37.03 
 
 		 437 aa  212  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  35.75 
 
 		 406 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  36.41 
 
 		 367 aa  209  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  36.19 
 
 		 406 aa  208  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  35.05 
 
 		 398 aa  199  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  34.1 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  34.7 
 
 		 403 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  32.38 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  32.7 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  32.63 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  30.27 
 
 		 446 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  32.64 
 
 		 438 aa  166  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  31.97 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  28.69 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  28.76 
 
 		 412 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  27.38 
 
 		 407 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  25.53 
 
 		 439 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  25.59 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  24.28 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  24.47 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  24.92 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  24.62 
 
 		 449 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  23.43 
 
 		 358 aa  52.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>