46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2760 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  90.2 
 
 		 396 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  719    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  41.18 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  41.74 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  40.29 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  40.86 
 
 		 375 aa  269  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  39.5 
 
 		 377 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  39.5 
 
 		 379 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  39.71 
 
 		 375 aa  265  8e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  39.22 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  39.22 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  40.9 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  40.62 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  40.06 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  40.06 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  38.55 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  40.06 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  37.99 
 
 		 385 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  37.15 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  37.25 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  36.21 
 
 		 365 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  32.15 
 
 		 398 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  33.61 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  31.79 
 
 		 417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  29.19 
 
 		 446 aa  146  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  31.28 
 
 		 437 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  30.46 
 
 		 450 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  30.4 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  31.18 
 
 		 406 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  29.64 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  27.9 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  30.67 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  29.82 
 
 		 408 aa  125  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  29.14 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  29.24 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  26.27 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  28.11 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  27.12 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  26.16 
 
 		 438 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.87 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  22.73 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  22.93 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  23.34 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  24.1 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  21.71 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>