46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3911 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  802    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  90.2 
 
 		 357 aa  664    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  39.21 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  38.68 
 
 		 377 aa  279  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  39.16 
 
 		 379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  38.06 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  39.37 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  36.58 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  36.32 
 
 		 377 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  38.34 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  38.42 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  36.94 
 
 		 374 aa  258  9e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  37.64 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  38.18 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  37.89 
 
 		 375 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  37.89 
 
 		 375 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  36.58 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  36.51 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  36.25 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  35.85 
 
 		 375 aa  222  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  33.87 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  34.2 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  32.18 
 
 		 441 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  31.5 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  29.35 
 
 		 446 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  31.64 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  30.71 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  29.92 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  30.94 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  32.07 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  30.48 
 
 		 437 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  30.62 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  28.73 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  29.9 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  28.61 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  30.48 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  26.93 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  28.86 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  25.8 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  25.35 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  22.87 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.58 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  22.89 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  23.32 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  22.37 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  20.72 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>