46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3987 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  91.31 
 
 		 449 aa  816    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  100 
 
 		 449 aa  917    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  90.74 
 
 		 432 aa  808    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  69.52 
 
 		 446 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  71.05 
 
 		 439 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  63.41 
 
 		 432 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  30.18 
 
 		 441 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  30.69 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  28.18 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  26.25 
 
 		 405 aa  103  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  26.1 
 
 		 446 aa  97.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  24.95 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  25 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  25.97 
 
 		 379 aa  93.2  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  24.3 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  23.83 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  24.4 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  24.64 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  23.94 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  25.19 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  24.77 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  23.41 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  24.94 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  24.29 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  87  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  25.59 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  24.27 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  24.67 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  25.07 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  22.99 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  24.75 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  24.28 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  24.32 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  23.82 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  23.06 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  23.96 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  23.96 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  22.94 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  22.93 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  23.16 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  22.72 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  23.51 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  22.97 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  23.12 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>