47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0345 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  793    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  77.92 
 
 		 377 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  77.92 
 
 		 377 aa  627  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  77.14 
 
 		 377 aa  621  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  77.4 
 
 		 377 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  76.94 
 
 		 378 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  73.25 
 
 		 379 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  74.29 
 
 		 375 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  71.69 
 
 		 377 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  69.43 
 
 		 379 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  70.13 
 
 		 375 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  68.68 
 
 		 374 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  66.32 
 
 		 375 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  66.15 
 
 		 391 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  63.61 
 
 		 375 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  63.61 
 
 		 375 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  64.95 
 
 		 375 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  54.57 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  47.07 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  37.99 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  36.25 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  34.5 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  35.04 
 
 		 417 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  34.7 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  34.11 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  33 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  35.23 
 
 		 450 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  33.06 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  33.16 
 
 		 372 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  31.47 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  34.35 
 
 		 403 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  32.8 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  33.51 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  33.42 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  32.81 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  29.92 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  31.08 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  30.4 
 
 		 416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  27.92 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  27.91 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  24.28 
 
 		 449 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  23.82 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  23.29 
 
 		 432 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.29 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  22.99 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  21.54 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  24.63 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>