46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8582 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  100 
 
 		 432 aa  884    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  69.86 
 
 		 439 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  66.91 
 
 		 446 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  64.5 
 
 		 449 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  63.01 
 
 		 449 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  63.01 
 
 		 432 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  27.99 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  27.82 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  26.59 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  25.77 
 
 		 446 aa  103  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  26.52 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  25.68 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  23.35 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  23.87 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  24.39 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  24.49 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  26.89 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  26.89 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  23.1 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  25.25 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  23.74 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  24.02 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  25.95 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  24.74 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  25.97 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  22.92 
 
 		 377 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  25.53 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  25.24 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  24.47 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  24.48 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  22.36 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  24.02 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  23.61 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  21.81 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  24.48 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  23.51 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  23.82 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  23.99 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  22.85 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  23.08 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  21.96 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  25.38 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  23.64 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  22.37 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  23.2 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  24.1 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>