47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3099 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  907    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  66.76 
 
 		 398 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  53.27 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  52.31 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  55.97 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  51.6 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  45.21 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  55.53 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  50.64 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  46.67 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  37.16 
 
 		 446 aa  279  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  38.95 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  37.91 
 
 		 405 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  38.01 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  36.61 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  35.96 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  35.96 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  37.03 
 
 		 375 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  35.93 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  34.17 
 
 		 377 aa  206  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  34.17 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  36.44 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  35.71 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  35.15 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  33.75 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  33.67 
 
 		 377 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  33.92 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  33.84 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  34.33 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  33.79 
 
 		 377 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  34.42 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  32.6 
 
 		 372 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  31.65 
 
 		 365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  28.02 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  31.15 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  31.28 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  31.63 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  28.75 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  26.84 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  27.49 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  22.58 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  23.41 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  22.57 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  24.49 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.02 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  22.22 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>