17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1910 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1910  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  736    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  29.26 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  23.77 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  25.76 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  25.52 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  26.51 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  26.59 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  27.5 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  24.48 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  24.76 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  26.67 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  27.06 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  24.84 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  22.91 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  22.02 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  24.7 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>