48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0301 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  85.94 
 
 		 377 aa  681    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  87 
 
 		 377 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  94.71 
 
 		 378 aa  709    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  97.88 
 
 		 377 aa  757    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  770    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  82.85 
 
 		 379 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  76.39 
 
 		 375 aa  621  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  78.76 
 
 		 374 aa  621  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  77.72 
 
 		 375 aa  614  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  77.4 
 
 		 385 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  73.81 
 
 		 379 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  73.74 
 
 		 377 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  68.52 
 
 		 391 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  69.73 
 
 		 375 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  66.84 
 
 		 375 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  66.84 
 
 		 375 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  68.47 
 
 		 375 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  57.06 
 
 		 372 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  46.88 
 
 		 365 aa  348  9e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  39.5 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  36.58 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  36.07 
 
 		 406 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  36.17 
 
 		 367 aa  209  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  35.95 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  34.78 
 
 		 437 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  34.41 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  36.34 
 
 		 450 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  35.71 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  33.61 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  32.79 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  33.69 
 
 		 398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  34.78 
 
 		 408 aa  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  34.4 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  33.7 
 
 		 405 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  30.77 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  32.14 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  32 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  28.88 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  27.91 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  27.34 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  23.38 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  24.73 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  23.1 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  23.12 
 
 		 439 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  23.94 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.67 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  24.38 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1910  hypothetical protein  24.7 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>