46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1371 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  761    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  59.28 
 
 		 377 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  58.56 
 
 		 379 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  59.4 
 
 		 379 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  58.73 
 
 		 377 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  55.5 
 
 		 377 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  60 
 
 		 378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  57.06 
 
 		 377 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  58.64 
 
 		 375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  57.34 
 
 		 377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  57.18 
 
 		 374 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  55.4 
 
 		 375 aa  431  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  56.18 
 
 		 375 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  56.18 
 
 		 375 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  54.84 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  53.76 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  54.57 
 
 		 385 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  54.96 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  45.35 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  36.51 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  37.15 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  31.79 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  32.32 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  31.06 
 
 		 417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  33.16 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  31.62 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  31.35 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  30.27 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  31.55 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  32.62 
 
 		 408 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  32.24 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  31.45 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  29.48 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  30.55 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  27.72 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  28.11 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  28.96 
 
 		 438 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  26.1 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  26.16 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  24.17 
 
 		 439 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  22.56 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  22.99 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  22.36 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  22.36 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  22.05 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>