47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2227 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  83.47 
 
 		 391 aa  663    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  88 
 
 		 375 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  762    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  762    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  76.7 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  68.45 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  70.11 
 
 		 375 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  67.38 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  66.84 
 
 		 377 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  70.66 
 
 		 378 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  66.84 
 
 		 377 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  66.84 
 
 		 379 aa  531  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  66.57 
 
 		 374 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  64.97 
 
 		 377 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  62.83 
 
 		 379 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  63.99 
 
 		 375 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  63.61 
 
 		 385 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  56.18 
 
 		 372 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  49.32 
 
 		 365 aa  348  6e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  40.06 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  37.89 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  37.4 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  36.56 
 
 		 437 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  35.66 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  37.99 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  37.99 
 
 		 450 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  36.31 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  35.26 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  35.81 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  35.58 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  33.42 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  33.88 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  31.25 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  32.81 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  32.55 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  32.05 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  28.84 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  29.55 
 
 		 412 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  29.1 
 
 		 407 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  26.73 
 
 		 439 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  24.68 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  26.89 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  23.96 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  25.79 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  25.79 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  23.43 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>