47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0274 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  82.49 
 
 		 375 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  778    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  89.92 
 
 		 377 aa  711    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  87.57 
 
 		 378 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  87 
 
 		 377 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  86.54 
 
 		 379 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  86.74 
 
 		 377 aa  690    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  77.92 
 
 		 385 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  75.81 
 
 		 374 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  74.01 
 
 		 375 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  73.21 
 
 		 377 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  72.75 
 
 		 379 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  70.18 
 
 		 391 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  71.08 
 
 		 375 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  68.45 
 
 		 375 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  68.45 
 
 		 375 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  68.47 
 
 		 375 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  59.28 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  47.87 
 
 		 365 aa  352  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  41.74 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  38.68 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  36.51 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  36.97 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  34.96 
 
 		 417 aa  206  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  35.15 
 
 		 437 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  35.41 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  34.72 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  34.69 
 
 		 441 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  35.68 
 
 		 450 aa  192  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  33.58 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  35.45 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  32.91 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  31.83 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  33.15 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  32.54 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  30.94 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  30.79 
 
 		 446 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  30.21 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  29.73 
 
 		 412 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  29.25 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  24.19 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  24.34 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  22.92 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  23.24 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  23.74 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  23.74 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  25.31 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>