47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2762 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2762  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  836    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.344845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  36.92 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1848  hypothetical protein  33.51 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000273162  hitchhiker  0.00000431867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  32.57 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3355  hypothetical protein  34.01 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000520077  hitchhiker  0.000269034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2854  hypothetical protein  31.09 
 
 		 367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4238  hypothetical protein  32.23 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00134232  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3938  hypothetical protein  31.2 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3099  hypothetical protein  31.63 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0854983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4910  hypothetical protein  30.6 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  29.25 
 
 		 377 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  31.38 
 
 		 450 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  28.78 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  27.82 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1954  hypothetical protein  28.9 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0562969  normal  0.072351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00600  hypothetical protein  28.57 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  27.34 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  29.1 
 
 		 375 aa  126  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  29.1 
 
 		 375 aa  126  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  26.86 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3987  putative signal peptide  30.69 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  29.02 
 
 		 378 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3854  hypothetical protein  31.47 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  28.71 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  27.38 
 
 		 375 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3405  putative signal peptide  29.47 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4006  hypothetical protein  31.65 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  27.27 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  27.92 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  26.91 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4029  putative signal peptide  28.89 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.286763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3734  putative signal peptide  28.39 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0144  hypothetical protein  25.52 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  25.78 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  26.33 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  26.39 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1371  hypothetical protein  26.16 
 
 		 372 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  26.56 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2489  putative signal peptide  28.57 
 
 		 446 aa  106  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  25.06 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8582  putative signal peptide  26.59 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3911  hypothetical protein  25.8 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2760  hypothetical protein  27.12 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1648  hypothetical protein  25.57 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.112109  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0153  hypothetical protein  26.17 
 
 		 446 aa  94  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2358  hypothetical protein  25.69 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1910  hypothetical protein  23.77 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>