23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0236 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0236  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  725    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000273252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1910  hypothetical protein  29.26 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0294778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3235  hypothetical protein  25.76 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4186  hypothetical protein  25.56 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0323  hypothetical protein  24.75 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0274  hypothetical protein  25.31 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4182  hypothetical protein  24.69 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.322884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4044  hypothetical protein  22.73 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1412  hypothetical protein  24.38 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0257  hypothetical protein  23.43 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0301  hypothetical protein  24.38 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0578394  normal  0.132652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0345  hypothetical protein  24.39 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.642173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2682  hypothetical protein  23.37 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3298  hypothetical protein  24.3 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2536  hypothetical protein  24.31 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3533  hypothetical protein  23.43 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2227  hypothetical protein  23.43 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2150  hypothetical protein  23.43 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160845  normal  0.137202 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2706  hypothetical protein  25.19 
 
 		 365 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.259967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3894  hypothetical protein  24.1 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.926203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2506  hypothetical protein  23.26 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5467  hypothetical protein  24.44 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0254  hypothetical protein  24.35 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.313885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>