73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5209 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5209  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  61.76 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  37.74 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  38.68 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  30.77 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 176 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  37.89 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  32.59 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  34.88 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  29.79 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0820  Endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  38.75 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  33.78 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  26.02 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  35.21 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  24.48 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  27.91 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  25.87 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  33.8 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  26.02 
 
 		 130 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  25.87 
 
 		 140 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  25.87 
 
 		 140 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 130 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  28.06 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  31.08 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  31.94 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  25.17 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  30 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  25.87 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  31.08 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1859  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  31.94 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  25.17 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  25.17 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.94 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  27.97 
 
 		 141 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>