134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0763 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0763  Cro/CI family transcriptional regulator-related protein  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0794  DNA-binding protein  70.3 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2627  transcriptional regulator  51 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0561718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0638  transcriptional regulator, XRE family  47.47 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606399  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1232  transcriptional regulator protein  44.44 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00074  DNA-binding protein  47.42 
 
 		 101 aa  106  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0156  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0056  putative DNA-binding protein  47.37 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000362045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3644  DNA-binding protein  50.53 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5091  putative DNA-binding protein  48.96 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0262962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4004  DNA-binding protein  47.92 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4174  DNA-binding protein  47.92 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4027  putative DNA-binding protein  48.96 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678777 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0024  DNA-binding protein  46.32 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.31955  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7082  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4109  DNA-binding protein  49.46 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1246  transcriptional regulator-like protein  46.46 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2181  transcriptional regulator, XRE family  47.96 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2974  XRE family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0921  DNA-binding protein  58.67 
 
 		 75 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.451921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3986  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4058  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326996  normal  0.47831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1497  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.243266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1845  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3694  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.516749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0125  hypothetical protein  44.68 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1818  XRE family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1503  putative DNA-binding protein  48 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.114051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1619  hypothetical protein  40.4 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2677  helix-turn-helix domain-containing protein  43.88 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1782  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1811  XRE family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4237  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4706  helix-turn-helix domain-containing protein  41.41 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2978  transcriptional regulator-like protein  41.49 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3031  transcriptional regulator-like protein  41.49 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2894  transcriptional regulator-like protein  41.49 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4312  transcriptional regulator, XRE family  41 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0881286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0164  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.862423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1536  XRE family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 105 aa  90.5  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2370  transcriptional regulator-like  40.43 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2984  transcriptional regulator-like protein  40.43 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3004  transcriptional regulator-like protein  40.43 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6333  transcriptional regulator-like  40.43 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0850  XRE family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.07607  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2087  XRE family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4182  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2546  transcriptional regulator, XRE family  40.4 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0471  putative transcriptional regulator  36.89 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3428  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3898  helix-turn-helix domain-containing protein  47.27 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4309  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00238443  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1290  hypothetical protein  46.67 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.91858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1852  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00565598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0567  hypothetical protein  53.49 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1115  DNA-binding protein, putative  45.28 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4938  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0484665  hitchhiker  0.0000000184601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2738  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1953  helix-turn-helix domain-containing protein  45.83 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1405  hypothetical protein  47.27 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.923263  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0986  helix-turn-helix DNA-binding domain protein  29.91 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.45543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0893  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.641947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2809  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0860  DNA-binding protein  29.91 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4415  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0269  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.506568  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31050  DNA-binding protein  45.83 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0720  hypothetical protein  48.94 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.719881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0304  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1198  Cro/CI family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0975  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4246  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2833  hypothetical protein  34.43 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1042  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3209  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4313  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4424  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4359  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3172  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100844 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0485  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4268  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04240  Transcriptional regulator with Fis-type helix-turn-helix motif  37.14 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2380  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740526  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000318206  hitchhiker  0.000000295064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0468  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4125  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1709  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105629  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3074  helix-turn-helix type 3  40.43 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.620865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2433  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31960  transcriptional regulator protein  38.18 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0283  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5139  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576626  normal  0.0207575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3850  virulence gene repressor RsaL  43.75 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5216  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4790  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0605  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1708  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4437  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>