34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0567 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  222  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0024  DNA-binding protein  47.83 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.31955  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0056  putative DNA-binding protein  47.83 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000362045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0763  Cro/CI family transcriptional regulator-related protein  53.49 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4706  helix-turn-helix domain-containing protein  46.81 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2677  helix-turn-helix domain-containing protein  39.44 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110858  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4312  transcriptional regulator, XRE family  61.54 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0881286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0921  DNA-binding protein  41.86 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.451921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3644  DNA-binding protein  51.35 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2627  transcriptional regulator  48.72 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0561718 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1818  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1246  transcriptional regulator-like protein  41.86 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0794  DNA-binding protein  47.37 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4174  DNA-binding protein  44.19 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4004  DNA-binding protein  44.19 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3986  DNA-binding protein  44.19 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4109  DNA-binding protein  44.19 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4058  DNA-binding protein  44.19 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326996  normal  0.47831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0156  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5091  putative DNA-binding protein  39.06 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0262962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4027  putative DNA-binding protein  39.06 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2181  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4237  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3694  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.516749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2087  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0471  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0850  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 100 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.07607  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1845  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7082  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0164  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.862423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00074  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1536  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1503  putative DNA-binding protein  45.95 
 
 		 107 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.114051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1782  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 107 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.244304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>