91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3209 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3209  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  207  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7082  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3986  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4058  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326996  normal  0.47831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3694  transcriptional regulator, XRE family  52.94 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.516749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4109  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4004  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4027  putative DNA-binding protein  49.12 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5091  putative DNA-binding protein  49.12 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0262962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4174  DNA-binding protein  52.94 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3850  virulence gene repressor RsaL  36.26 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1708  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1782  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1503  putative DNA-binding protein  44.29 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.114051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1497  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.243266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2677  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110858  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1811  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3602  helix-turn-helix domain-containing protein  60 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2181  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0720  hypothetical protein  54 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.719881  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0803  hypothetical protein  29.35 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04240  Transcriptional regulator with Fis-type helix-turn-helix motif  49.25 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0139  XRE family transcriptional regulator  54 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0306  hypothetical protein  55.32 
 
 		 53 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425505  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3446  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0283  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0975  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0164  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.862423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1536  XRE family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793365 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0068  hypothetical protein  33.67 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00074  DNA-binding protein  42.59 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0182  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1413  virulence gene repressor RsaL  27.17 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48830  hypothetical protein  29.67 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0304  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1115  DNA-binding protein, putative  29.52 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0786  helix-turn-helix domain-containing protein  48.08 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1818  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3898  helix-turn-helix domain-containing protein  44.64 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0763  Cro/CI family transcriptional regulator-related protein  45.45 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1993  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1645  putative DNA-binding protein, putative phage gene  26.09 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0024  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.31955  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5658  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0056  putative DNA-binding protein  36.36 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000362045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3644  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0317  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0550269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000318206  hitchhiker  0.000000295064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0468  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1845  transcriptional regulator, XRE family  35.35 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2087  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1042  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0893  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.641947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2809  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0860  DNA-binding protein  34.52 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0986  helix-turn-helix DNA-binding domain protein  34.52 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.45543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3428  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117512 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1912  helix-turn-helix domain-containing protein  31.87 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4706  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2974  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3172  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0850  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.07607  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31050  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0156  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4237  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1676  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0794  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0638  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606399  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2978  transcriptional regulator-like protein  37.93 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0605  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4312  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0881286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3537  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1541  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0274839  hitchhiker  0.00170157 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4309  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00238443  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0471  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2738  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3004  transcriptional regulator-like protein  36.21 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  47.92 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.425253  normal  0.20556 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2984  transcriptional regulator-like protein  36.21 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1232  transcriptional regulator protein  33.33 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2370  transcriptional regulator-like  36.21 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2894  transcriptional regulator-like protein  36.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4437  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 119 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3031  transcriptional regulator-like protein  36.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4182  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 111 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6333  transcriptional regulator-like  36.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0125  hypothetical protein  34.48 
 
 		 106 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2627  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0561718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0653  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.717365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>