100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_48830  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  211  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1413  virulence gene repressor RsaL  40.38 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1645  putative DNA-binding protein, putative phage gene  38.46 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0803  hypothetical protein  39.42 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3850  virulence gene repressor RsaL  35.64 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2738  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1246  transcriptional regulator-like protein  36.59 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1115  DNA-binding protein, putative  32.65 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2230  transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.23704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1708  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0125  hypothetical protein  38.67 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5216  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2627  transcriptional regulator  36 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0561718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4125  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5139  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576626  normal  0.0207575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3172  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000318206  hitchhiker  0.000000295064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3788  hypothetical protein  42.37 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0468  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0283  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2978  transcriptional regulator-like protein  33.33 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0975  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3602  helix-turn-helix domain-containing protein  29.06 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2370  transcriptional regulator-like  34.72 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3031  transcriptional regulator-like protein  34.72 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2984  transcriptional regulator-like protein  34.72 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2894  transcriptional regulator-like protein  34.72 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3004  transcriptional regulator-like protein  34.72 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2974  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3209  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3537  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3174  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.024202  normal  0.0514125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7348  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1845  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2087  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1042  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6333  transcriptional regulator-like  33.33 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1852  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00565598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1497  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.243266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0605  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3065  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0317  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0550269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4938  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0484665  hitchhiker  0.0000000184601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0921  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.451921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0304  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0786  helix-turn-helix domain-containing protein  27.72 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1198  Cro/CI family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1818  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1811  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2833  hypothetical protein  35.09 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3428  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0653  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4790  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4706  helix-turn-helix domain-containing protein  32.5 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4109  DNA-binding protein  39.22 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7082  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4437  transcriptional regulator, XRE family  26.25 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1765  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0763  Cro/CI family transcriptional regulator-related protein  34.78 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00074  DNA-binding protein  35.06 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1487  helix-turn-helix domain-containing protein  39.58 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31960  transcriptional regulator protein  29.03 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1782  transcriptional regulator, XRE family  28.41 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0720  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.719881  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3986  DNA-binding protein  37.25 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0794  DNA-binding protein  33.8 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3694  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.516749  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4058  DNA-binding protein  37.25 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326996  normal  0.47831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4027  putative DNA-binding protein  39.22 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3671  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179939  normal  0.801246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5091  putative DNA-binding protein  39.22 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0262962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1503  putative DNA-binding protein  28.41 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.114051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2202  helix-turn-helix domain-containing protein  30.95 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.119587 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4237  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4004  DNA-binding protein  37.25 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4174  DNA-binding protein  37.25 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31050  DNA-binding protein  30.53 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0156  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3898  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0269  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.506568  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1953  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3644  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0139  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554857  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1232  transcriptional regulator protein  29.89 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4415  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4182  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2477  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229914  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2181  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5658  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1506  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735616  normal  0.160374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  24.75 
 
 		 103 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0164  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.862423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04240  Transcriptional regulator with Fis-type helix-turn-helix motif  29.21 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0928  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  0.315243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1536  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2677  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110858  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2546  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3971  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>