38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1290 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1290  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.91858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1405  hypothetical protein  97.22 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.923263  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0850  XRE family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.07607  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1619  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0794  DNA-binding protein  50 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0638  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606399  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00074  DNA-binding protein  49.12 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0763  Cro/CI family transcriptional regulator-related protein  46.67 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2974  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1232  transcriptional regulator protein  45 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0156  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2546  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7082  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1536  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4312  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0881286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2627  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0561718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1246  transcriptional regulator-like protein  40.68 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0024  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.31955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2181  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0056  putative DNA-binding protein  37.5 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000362045  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2087  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2978  transcriptional regulator-like protein  39.62 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0164  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.862423  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1782  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3644  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1503  putative DNA-binding protein  38.98 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.114051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2894  transcriptional regulator-like protein  36.67 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3031  transcriptional regulator-like protein  36.67 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4237  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 103 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6333  transcriptional regulator-like  39.62 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1497  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.243266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2370  transcriptional regulator-like  39.62 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3004  transcriptional regulator-like protein  39.62 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2984  transcriptional regulator-like protein  39.62 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1811  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1818  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4004  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4174  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>