More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2078 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  44.43 
 
 		 805 aa  704    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1155  hypothetical protein  61.3 
 
 		 783 aa  964    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  52.61 
 
 		 746 aa  836    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  80.05 
 
 		 747 aa  1237    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2078  peptidase U32  100 
 
 		 746 aa  1536    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.292848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  73.22 
 
 		 757 aa  1114    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  78.79 
 
 		 748 aa  1194    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  55.65 
 
 		 663 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  55.11 
 
 		 663 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  27.82 
 
 		 810 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  39.5 
 
 		 783 aa  244  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  27.24 
 
 		 825 aa  243  6e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  30.63 
 
 		 783 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  42.5 
 
 		 839 aa  237  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  44.67 
 
 		 790 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  42.42 
 
 		 767 aa  232  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  43.89 
 
 		 822 aa  230  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  37.53 
 
 		 828 aa  227  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  26.03 
 
 		 847 aa  226  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  26.82 
 
 		 835 aa  226  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  40.97 
 
 		 886 aa  226  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  43 
 
 		 792 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  43.67 
 
 		 818 aa  224  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  43.14 
 
 		 835 aa  223  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  28.03 
 
 		 783 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  27.93 
 
 		 783 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  40.26 
 
 		 838 aa  221  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  40.94 
 
 		 823 aa  221  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  39.93 
 
 		 862 aa  221  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  26.83 
 
 		 817 aa  221  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  44.4 
 
 		 790 aa  219  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  44.62 
 
 		 790 aa  217  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  42.25 
 
 		 792 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  42.25 
 
 		 790 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  38.67 
 
 		 826 aa  213  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  36.57 
 
 		 840 aa  213  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  36.65 
 
 		 407 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  38.93 
 
 		 835 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  42.14 
 
 		 746 aa  209  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  38.46 
 
 		 851 aa  209  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  39.53 
 
 		 668 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  30.52 
 
 		 872 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  36.42 
 
 		 672 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  35.99 
 
 		 826 aa  205  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  37.85 
 
 		 667 aa  204  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  38.11 
 
 		 666 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  36.83 
 
 		 654 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  36.83 
 
 		 654 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  36.16 
 
 		 653 aa  204  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  35.34 
 
 		 848 aa  204  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  36.83 
 
 		 654 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  39.03 
 
 		 852 aa  204  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  36.83 
 
 		 654 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  36.83 
 
 		 654 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  36.16 
 
 		 653 aa  204  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  36.16 
 
 		 667 aa  204  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  36.16 
 
 		 667 aa  204  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  36.16 
 
 		 667 aa  204  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  36.16 
 
 		 667 aa  204  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  36.16 
 
 		 653 aa  204  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  36.16 
 
 		 653 aa  204  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  38.19 
 
 		 877 aa  203  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  38.94 
 
 		 666 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  38.94 
 
 		 666 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  38.87 
 
 		 668 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  38.38 
 
 		 832 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  36.05 
 
 		 621 aa  200  9e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  36.91 
 
 		 652 aa  200  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  37.21 
 
 		 837 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.27 
 
 		 411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  36.64 
 
 		 736 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  41.57 
 
 		 655 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.57 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  38.99 
 
 		 839 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2870  peptidase U32  38.28 
 
 		 666 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.615102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  36.14 
 
 		 669 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  37.14 
 
 		 654 aa  199  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  39.53 
 
 		 723 aa  198  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  38.21 
 
 		 669 aa  198  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  37.58 
 
 		 622 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  35.82 
 
 		 835 aa  197  5.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2285  peptidase U32  36.88 
 
 		 692 aa  197  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.437271  normal  0.0318374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1589  peptidase U32  36.56 
 
 		 667 aa  197  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  40.07 
 
 		 878 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  38.36 
 
 		 641 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2431  peptidase U32  38.21 
 
 		 657 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  37.5 
 
 		 836 aa  196  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  37.7 
 
 		 638 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  40.34 
 
 		 843 aa  194  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  37.5 
 
 		 649 aa  194  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4811  peptidase U32  35.71 
 
 		 668 aa  194  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0604959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  38.36 
 
 		 638 aa  194  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  37.38 
 
 		 638 aa  193  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  37.38 
 
 		 638 aa  193  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  37.22 
 
 		 644 aa  193  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  40.67 
 
 		 639 aa  193  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  37.83 
 
 		 426 aa  193  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2383  peptidase U32  37.87 
 
 		 662 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000437173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  37.95 
 
 		 637 aa  193  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  37.22 
 
 		 629 aa  192  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>