More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0064 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  51.33 
 
 		 790 aa  776    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  50.38 
 
 		 790 aa  771    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  100 
 
 		 790 aa  1619    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  50.88 
 
 		 790 aa  769    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  48.19 
 
 		 818 aa  697    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  47.32 
 
 		 822 aa  704    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  50 
 
 		 792 aa  777    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  52.46 
 
 		 792 aa  800    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  42.08 
 
 		 746 aa  316  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  43.59 
 
 		 696 aa  313  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  31.79 
 
 		 839 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  33.69 
 
 		 872 aa  300  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  31.81 
 
 		 835 aa  297  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  31.99 
 
 		 836 aa  297  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  39.61 
 
 		 838 aa  292  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  35.16 
 
 		 847 aa  292  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  44.06 
 
 		 783 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  28.61 
 
 		 817 aa  290  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  34.69 
 
 		 810 aa  290  9e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  37.2 
 
 		 848 aa  281  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  37.11 
 
 		 783 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  39.73 
 
 		 835 aa  280  5e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  37.11 
 
 		 783 aa  280  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  37.38 
 
 		 886 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  34.12 
 
 		 837 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  32.4 
 
 		 862 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  34.81 
 
 		 783 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  41.16 
 
 		 767 aa  264  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  36.28 
 
 		 823 aa  262  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  31.99 
 
 		 835 aa  257  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  36.62 
 
 		 839 aa  252  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  28.51 
 
 		 723 aa  249  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  42.17 
 
 		 826 aa  247  8e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  31.03 
 
 		 832 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  36.83 
 
 		 873 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  44.97 
 
 		 877 aa  245  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  28.39 
 
 		 878 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  34.77 
 
 		 852 aa  243  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  33.97 
 
 		 828 aa  243  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  38.34 
 
 		 419 aa  243  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  31.05 
 
 		 805 aa  242  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  31.84 
 
 		 826 aa  241  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  33.33 
 
 		 840 aa  238  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  28.11 
 
 		 834 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  38.83 
 
 		 411 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  34.95 
 
 		 746 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  39.49 
 
 		 805 aa  234  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  47.58 
 
 		 435 aa  233  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  37.31 
 
 		 406 aa  230  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  29.72 
 
 		 722 aa  230  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  33.75 
 
 		 825 aa  228  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  37.39 
 
 		 736 aa  227  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.54 
 
 		 411 aa  227  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  40.49 
 
 		 716 aa  227  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  38.44 
 
 		 851 aa  226  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  40.23 
 
 		 404 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  38.03 
 
 		 407 aa  226  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  44.97 
 
 		 747 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  44.08 
 
 		 748 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  40.07 
 
 		 430 aa  224  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  36.32 
 
 		 841 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  34.1 
 
 		 835 aa  218  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  41.22 
 
 		 548 aa  218  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  43.84 
 
 		 757 aa  218  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  33.27 
 
 		 843 aa  217  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  37.88 
 
 		 405 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  33.95 
 
 		 833 aa  213  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  40.98 
 
 		 406 aa  213  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0957  collagenase-like protease  43.82 
 
 		 643 aa  213  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0908875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  35.05 
 
 		 413 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  37.32 
 
 		 403 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  39.33 
 
 		 420 aa  211  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  34.45 
 
 		 408 aa  210  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  35.81 
 
 		 404 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2078  peptidase U32  44.67 
 
 		 746 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.292848  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  41.03 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  42.01 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  35.03 
 
 		 426 aa  207  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  31.19 
 
 		 638 aa  207  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  42.01 
 
 		 409 aa  207  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  38.49 
 
 		 439 aa  206  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  38.97 
 
 		 422 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  42.58 
 
 		 663 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  40.45 
 
 		 411 aa  206  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  37.99 
 
 		 656 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  36.87 
 
 		 427 aa  206  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  39.93 
 
 		 411 aa  205  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  28.06 
 
 		 621 aa  205  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  38.36 
 
 		 439 aa  205  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  42.58 
 
 		 663 aa  204  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  34.51 
 
 		 622 aa  204  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  31.78 
 
 		 638 aa  204  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  33.51 
 
 		 428 aa  203  8e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  33.01 
 
 		 413 aa  203  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1155  hypothetical protein  42.76 
 
 		 783 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  37.43 
 
 		 412 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  35.38 
 
 		 629 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0058  U32 family peptidase  36.96 
 
 		 748 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  30.46 
 
 		 638 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0074  peptidase U32  41.98 
 
 		 697 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>