More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0888 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  76.87 
 
 		 404 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  100 
 
 		 403 aa  830    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  68.91 
 
 		 404 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  65.09 
 
 		 439 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  64.75 
 
 		 412 aa  524  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  62.81 
 
 		 410 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  57.84 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  52.84 
 
 		 406 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  51.48 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  50.37 
 
 		 408 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  51.35 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  51.13 
 
 		 419 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  50.49 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  49 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  54 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  50.25 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  52.25 
 
 		 409 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  51.69 
 
 		 409 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  48.13 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  44.99 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  47.48 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  48.61 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  45.16 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  44.47 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  44.47 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  44.47 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  44.47 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  44.47 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  44.47 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  44.47 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  43.1 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  44.47 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  44.06 
 
 		 422 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  42.86 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  44.53 
 
 		 412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  43.18 
 
 		 411 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  43.81 
 
 		 422 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  42.96 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  43.14 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  42.36 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  42.36 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  43.41 
 
 		 439 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  43.63 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  48.32 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  40.05 
 
 		 428 aa  305  6e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  40.05 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  39.01 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  44.07 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  38.41 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  40.1 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  38.84 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  39.63 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  38.84 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  38.48 
 
 		 471 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  40.61 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  40.45 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  40.86 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  40.86 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  40.86 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  39.24 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  40.76 
 
 		 455 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  40.76 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  40.51 
 
 		 455 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  40 
 
 		 462 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  40.51 
 
 		 455 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  40.51 
 
 		 455 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  40.25 
 
 		 455 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  43.52 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  40.86 
 
 		 454 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  47.25 
 
 		 548 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  40 
 
 		 453 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  39.27 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  40.41 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  43.09 
 
 		 471 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  38.98 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  38.23 
 
 		 469 aa  282  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  39.39 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  40.83 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  39.35 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  40.96 
 
 		 423 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  38.72 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  40.18 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  37.74 
 
 		 463 aa  279  7e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  40.75 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  37.42 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  40.18 
 
 		 464 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  38.67 
 
 		 453 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  38.67 
 
 		 476 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  40.75 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  40.3 
 
 		 453 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  40.83 
 
 		 440 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  37.07 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  38.29 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  38.34 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  38.11 
 
 		 464 aa  270  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  38.11 
 
 		 464 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  38.42 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  39.22 
 
 		 494 aa  269  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  42.02 
 
 		 435 aa  269  7e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  40 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>