More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1526 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  100 
 
 
412 aa  851    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  96.35 
 
 
439 aa  820    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  65.67 
 
 
404 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  63.25 
 
 
404 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  64.75 
 
 
403 aa  524  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  61.61 
 
 
410 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  57.71 
 
 
413 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  51.48 
 
 
411 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  50.86 
 
 
406 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  50.75 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  49.26 
 
 
406 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  49.75 
 
 
419 aa  415  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  55.06 
 
 
406 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  48.02 
 
 
408 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  50.99 
 
 
407 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  50 
 
 
405 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  46.29 
 
 
426 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  47.13 
 
 
420 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  46.91 
 
 
411 aa  378  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  46.49 
 
 
409 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  46.49 
 
 
409 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  44.67 
 
 
427 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  53.47 
 
 
430 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  48.13 
 
 
435 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  44.5 
 
 
412 aa  353  4e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  45.05 
 
 
439 aa  350  3e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  44.61 
 
 
411 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  42.49 
 
 
426 aa  323  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  42.49 
 
 
426 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  42.49 
 
 
426 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  42.49 
 
 
426 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  42.49 
 
 
426 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  42.49 
 
 
426 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  42.49 
 
 
426 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  42.49 
 
 
426 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  42.24 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  41.98 
 
 
426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  41.34 
 
 
422 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  41.58 
 
 
422 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  41.48 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  39.9 
 
 
422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  40.9 
 
 
422 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  40.9 
 
 
422 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  47.09 
 
 
442 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  42.22 
 
 
430 aa  302  7.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  37.87 
 
 
428 aa  294  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  44.97 
 
 
418 aa  294  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  42.29 
 
 
423 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  38.46 
 
 
462 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  38.84 
 
 
453 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  39.3 
 
 
464 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  39.3 
 
 
464 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  39.3 
 
 
464 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  38.12 
 
 
450 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  38.37 
 
 
453 aa  286  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  39.29 
 
 
548 aa  286  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  37.35 
 
 
428 aa  285  7e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  40.2 
 
 
463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  43.77 
 
 
411 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  38.74 
 
 
453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  38.88 
 
 
462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  37.83 
 
 
447 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  40.44 
 
 
438 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  40.33 
 
 
453 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  40.33 
 
 
453 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  40.33 
 
 
453 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  40.33 
 
 
453 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  37.89 
 
 
458 aa  279  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  40.1 
 
 
453 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  38.05 
 
 
471 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  37.89 
 
 
458 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  39.38 
 
 
453 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  39.62 
 
 
440 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  38.01 
 
 
454 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  38.01 
 
 
454 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  38.01 
 
 
454 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  37.91 
 
 
455 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  40.1 
 
 
453 aa  276  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.51078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  40.1 
 
 
453 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  38.07 
 
 
455 aa  276  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  40.1 
 
 
453 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  40.1 
 
 
453 aa  276  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  40.1 
 
 
453 aa  276  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  36.69 
 
 
454 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  40.33 
 
 
453 aa  275  9e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  39.86 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  39.86 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  39.86 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  40.77 
 
 
440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  38.79 
 
 
458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  38.07 
 
 
455 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  38.07 
 
 
455 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  38.07 
 
 
455 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  39.49 
 
 
452 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  38.33 
 
 
453 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  37.83 
 
 
467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  39.1 
 
 
465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  39.89 
 
 
471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  37.82 
 
 
455 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  38.86 
 
 
453 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>