More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1237 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  47.53 
 
 
837 aa  750    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  100 
 
 
851 aa  1708    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  45.76 
 
 
852 aa  693    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  74.91 
 
 
843 aa  1233    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  48.76 
 
 
823 aa  736    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  45.32 
 
 
835 aa  650    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  48.82 
 
 
835 aa  738    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  41.63 
 
 
877 aa  589  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  40.7 
 
 
841 aa  555  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  41.96 
 
 
833 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  41.53 
 
 
847 aa  538  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  37.59 
 
 
826 aa  526  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  32.78 
 
 
847 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  29.59 
 
 
839 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  34.37 
 
 
838 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  31.99 
 
 
848 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  30.08 
 
 
886 aa  343  8e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  32.9 
 
 
836 aa  335  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  29.73 
 
 
835 aa  333  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  29.74 
 
 
810 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  30.65 
 
 
783 aa  323  6e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  40.91 
 
 
862 aa  323  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  27.48 
 
 
783 aa  322  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  27.32 
 
 
783 aa  320  9e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  28.71 
 
 
826 aa  296  8e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  29.33 
 
 
783 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  30.88 
 
 
872 aa  290  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  39.04 
 
 
835 aa  284  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  31.83 
 
 
873 aa  283  9e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  30.03 
 
 
828 aa  280  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  32.19 
 
 
840 aa  277  8e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  39.15 
 
 
839 aa  275  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  31.52 
 
 
767 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  30.64 
 
 
825 aa  271  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  39.39 
 
 
805 aa  268  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  26.23 
 
 
817 aa  264  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  37.48 
 
 
832 aa  258  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  31.55 
 
 
834 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  27.57 
 
 
878 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  31.61 
 
 
723 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  32.65 
 
 
790 aa  236  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  34.75 
 
 
746 aa  235  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  29.81 
 
 
716 aa  235  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  29.37 
 
 
736 aa  234  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  33.64 
 
 
629 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  38.44 
 
 
790 aa  233  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  37.16 
 
 
413 aa  229  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  30 
 
 
622 aa  228  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  32.12 
 
 
792 aa  227  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  37.37 
 
 
792 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  36.83 
 
 
790 aa  225  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  37.47 
 
 
790 aa  224  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  32.6 
 
 
653 aa  224  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  34.95 
 
 
818 aa  224  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  32.7 
 
 
654 aa  223  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.156367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  32.29 
 
 
653 aa  222  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  32.29 
 
 
653 aa  222  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  32.29 
 
 
667 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  32.29 
 
 
667 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  32.29 
 
 
667 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  32.1 
 
 
653 aa  220  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  32.1 
 
 
667 aa  220  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  26.94 
 
 
722 aa  219  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  32.9 
 
 
654 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  32.39 
 
 
822 aa  219  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  32.9 
 
 
654 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  39.81 
 
 
420 aa  218  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  32.9 
 
 
654 aa  218  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  32.9 
 
 
654 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  34.88 
 
 
409 aa  217  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  34.55 
 
 
409 aa  217  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  32.16 
 
 
635 aa  216  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  32.72 
 
 
654 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  28.46 
 
 
621 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  39.94 
 
 
696 aa  214  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  32.58 
 
 
666 aa  214  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  37.1 
 
 
420 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  41.1 
 
 
413 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  32.95 
 
 
666 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  35.68 
 
 
404 aa  211  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  32.95 
 
 
666 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  34.9 
 
 
413 aa  211  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  38.75 
 
 
430 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  37.33 
 
 
442 aa  208  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  32.39 
 
 
655 aa  208  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  32.46 
 
 
639 aa  207  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  40.56 
 
 
418 aa  207  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  40.59 
 
 
471 aa  205  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  33.92 
 
 
419 aa  205  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  36.62 
 
 
414 aa  204  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  35.29 
 
 
411 aa  204  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  33.06 
 
 
426 aa  204  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  33.06 
 
 
426 aa  204  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  33.06 
 
 
426 aa  204  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  33.06 
 
 
426 aa  204  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  33.06 
 
 
426 aa  204  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  33.06 
 
 
426 aa  204  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  33.06 
 
 
426 aa  204  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  33.06 
 
 
426 aa  204  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  33.61 
 
 
406 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>