More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1572 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  100 
 
 
832 aa  1681    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  47.95 
 
 
839 aa  664    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  43.06 
 
 
873 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  41.29 
 
 
783 aa  559  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  42.59 
 
 
805 aa  544  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  37.44 
 
 
834 aa  509  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  35.16 
 
 
847 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  35.14 
 
 
848 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  36.51 
 
 
835 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  36.38 
 
 
838 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  34.45 
 
 
862 aa  385  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  32.7 
 
 
810 aa  385  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  31.7 
 
 
886 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  32.28 
 
 
839 aa  369  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  30.68 
 
 
783 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  30.56 
 
 
783 aa  358  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  32.27 
 
 
872 aa  353  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  32.79 
 
 
836 aa  350  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  32.37 
 
 
840 aa  344  4e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  33.17 
 
 
835 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  32.25 
 
 
828 aa  332  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  31.43 
 
 
837 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  36.22 
 
 
835 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  31.44 
 
 
823 aa  294  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  48.52 
 
 
783 aa  291  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  32.72 
 
 
852 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  31.92 
 
 
843 aa  285  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  32 
 
 
847 aa  285  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  28.1 
 
 
817 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  35.11 
 
 
833 aa  281  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  28.25 
 
 
826 aa  275  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  29.9 
 
 
825 aa  272  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  31.06 
 
 
835 aa  271  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  31.19 
 
 
877 aa  271  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  29.8 
 
 
841 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  43.42 
 
 
767 aa  258  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  37.12 
 
 
851 aa  256  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  32.95 
 
 
716 aa  253  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  30.98 
 
 
790 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  32.61 
 
 
736 aa  246  9e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  32.22 
 
 
792 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  28.21 
 
 
876 aa  244  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  33.2 
 
 
723 aa  239  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  31.59 
 
 
722 aa  240  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  28.54 
 
 
826 aa  238  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  31.29 
 
 
822 aa  237  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  37.81 
 
 
411 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  28.31 
 
 
878 aa  232  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  38.75 
 
 
411 aa  230  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  31.31 
 
 
790 aa  230  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  38.35 
 
 
419 aa  228  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  32.27 
 
 
790 aa  228  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  44.84 
 
 
792 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.84 
 
 
406 aa  223  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  44.48 
 
 
790 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  45.1 
 
 
818 aa  221  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  39.38 
 
 
404 aa  220  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  30.63 
 
 
622 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  43.31 
 
 
410 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  36.27 
 
 
635 aa  213  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  36.36 
 
 
409 aa  213  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  40.13 
 
 
746 aa  211  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  44.08 
 
 
696 aa  211  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  36.05 
 
 
409 aa  211  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  43.31 
 
 
404 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  36.5 
 
 
405 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  35.65 
 
 
667 aa  209  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  30.34 
 
 
621 aa  209  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  37.35 
 
 
427 aa  208  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  40.83 
 
 
407 aa  207  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  42.61 
 
 
403 aa  206  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14790  peptidase U32  39.64 
 
 
667 aa  206  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  33.02 
 
 
653 aa  204  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  40.77 
 
 
413 aa  204  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  37.59 
 
 
439 aa  204  5e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  32.51 
 
 
667 aa  204  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  32.51 
 
 
667 aa  204  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  32.32 
 
 
653 aa  204  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  32.51 
 
 
667 aa  204  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  40.42 
 
 
404 aa  204  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  32.51 
 
 
667 aa  204  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  33.4 
 
 
654 aa  204  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  33.02 
 
 
653 aa  204  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  33.02 
 
 
653 aa  204  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  39.51 
 
 
430 aa  203  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  33.4 
 
 
654 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  33.4 
 
 
654 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  42.46 
 
 
411 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  33.4 
 
 
654 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  33.4 
 
 
654 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  33.08 
 
 
672 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  36.88 
 
 
420 aa  200  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  39.44 
 
 
412 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  36.91 
 
 
663 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  39.44 
 
 
426 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  36.58 
 
 
663 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  35.49 
 
 
406 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  39.08 
 
 
439 aa  196  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  31.79 
 
 
668 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  37.9 
 
 
435 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>