More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0040 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  61.43 
 
 		 790 aa  1002    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  79.62 
 
 		 790 aa  1283    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  60.48 
 
 		 792 aa  998    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  50.88 
 
 		 790 aa  788    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  100 
 
 		 790 aa  1600    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  52.58 
 
 		 818 aa  799    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  67.39 
 
 		 792 aa  1107    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  57.09 
 
 		 822 aa  901    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  43.58 
 
 		 696 aa  323  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  33.83 
 
 		 847 aa  321  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  30.34 
 
 		 783 aa  308  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  32.55 
 
 		 835 aa  307  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  40.64 
 
 		 746 aa  301  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  31.9 
 
 		 783 aa  302  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  36.35 
 
 		 783 aa  302  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  33.33 
 
 		 836 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  31.45 
 
 		 839 aa  296  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  32.61 
 
 		 848 aa  293  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  33.38 
 
 		 835 aa  292  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  30.16 
 
 		 817 aa  290  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  33.56 
 
 		 838 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  37.69 
 
 		 872 aa  284  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  31.22 
 
 		 810 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  39.09 
 
 		 862 aa  283  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  37.35 
 
 		 886 aa  280  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  32.25 
 
 		 767 aa  267  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  33.5 
 
 		 826 aa  267  5.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  30.46 
 
 		 723 aa  263  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  34.36 
 
 		 783 aa  263  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  32.48 
 
 		 837 aa  261  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  28.6 
 
 		 878 aa  251  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  37.74 
 
 		 805 aa  249  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  37.61 
 
 		 839 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  33.33 
 
 		 828 aa  244  5e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  34.98 
 
 		 823 aa  242  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  29.39 
 
 		 835 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  35.38 
 
 		 834 aa  239  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  29.35 
 
 		 877 aa  238  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  35.65 
 
 		 873 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  36.99 
 
 		 419 aa  232  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  34.54 
 
 		 852 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  44.36 
 
 		 716 aa  232  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  33.08 
 
 		 851 aa  231  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  33.95 
 
 		 826 aa  230  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  35.36 
 
 		 840 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  29.43 
 
 		 722 aa  228  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  38.14 
 
 		 404 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  37.29 
 
 		 411 aa  228  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  36.8 
 
 		 736 aa  227  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  38.13 
 
 		 407 aa  226  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  46.07 
 
 		 832 aa  224  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0074  peptidase U32  41 
 
 		 697 aa  221  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  42.8 
 
 		 439 aa  220  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  35.47 
 
 		 420 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  31.52 
 
 		 621 aa  217  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  33.98 
 
 		 825 aa  217  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  44.06 
 
 		 435 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  35.62 
 
 		 411 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  41.05 
 
 		 430 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  37.54 
 
 		 805 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  40.07 
 
 		 548 aa  214  5.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  33.4 
 
 		 835 aa  214  5.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  34.32 
 
 		 404 aa  214  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  37.6 
 
 		 406 aa  213  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  33.17 
 
 		 746 aa  213  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  32.95 
 
 		 843 aa  213  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  36.52 
 
 		 408 aa  212  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  43.49 
 
 		 422 aa  210  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  36.34 
 
 		 409 aa  210  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  38.46 
 
 		 403 aa  210  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  31.32 
 
 		 635 aa  208  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2141  peptidase U32  38.12 
 
 		 709 aa  209  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3248  peptidase U32  39.44 
 
 		 654 aa  209  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  38.56 
 
 		 420 aa  209  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1030  peptidase U32  36.95 
 
 		 656 aa  208  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  36.34 
 
 		 409 aa  208  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  35.03 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  33.49 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  43.36 
 
 		 663 aa  207  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14790  peptidase U32  41.79 
 
 		 667 aa  207  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  31.65 
 
 		 841 aa  207  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  42.97 
 
 		 663 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  41.67 
 
 		 471 aa  205  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  37.71 
 
 		 427 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0957  collagenase-like protease  43.24 
 
 		 643 aa  206  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0908875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  33.97 
 
 		 833 aa  205  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  45 
 
 		 747 aa  204  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  42.38 
 
 		 422 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  37.34 
 
 		 414 aa  202  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  36.22 
 
 		 413 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  38.17 
 
 		 656 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  44.06 
 
 		 748 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0058  U32 family peptidase  38.84 
 
 		 748 aa  202  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  34.92 
 
 		 426 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  44.57 
 
 		 418 aa  201  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  28.32 
 
 		 622 aa  201  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  37.03 
 
 		 667 aa  201  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  37.03 
 
 		 667 aa  201  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  37.03 
 
 		 667 aa  201  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  37.03 
 
 		 667 aa  201  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>