More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2024 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  100 
 
 		 409 aa  848    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  99.51 
 
 		 409 aa  844    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  62.22 
 
 		 406 aa  512  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  57.32 
 
 		 411 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  58.63 
 
 		 405 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  52.93 
 
 		 404 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  50.75 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  52.59 
 
 		 408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  51.6 
 
 		 407 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  51.87 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  50.25 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  48.46 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  47.94 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  52.25 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  46.52 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  48.44 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  46.32 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  47.68 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  47.69 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  46.89 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  46.08 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  46.08 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  46.08 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  46.08 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  46.08 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  45.83 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  46.08 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  46.08 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  45.83 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  46.49 
 
 		 412 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  45.83 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  47.63 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  45.72 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  45.19 
 
 		 430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  44.94 
 
 		 413 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  44.69 
 
 		 422 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  44.47 
 
 		 422 aa  358  9e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  44.47 
 
 		 422 aa  358  9e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  42.54 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  43.7 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  43.82 
 
 		 439 aa  349  6e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  42.65 
 
 		 435 aa  342  9e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  42.58 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  41.65 
 
 		 428 aa  339  4e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  40.33 
 
 		 411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  43.81 
 
 		 406 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  48.68 
 
 		 548 aa  325  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  39.78 
 
 		 471 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  40.58 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  44.22 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  42.27 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  41.13 
 
 		 462 aa  319  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  39.46 
 
 		 455 aa  317  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  39.86 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  45.81 
 
 		 471 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  38.69 
 
 		 454 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  38.69 
 
 		 454 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  39.23 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  40.48 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  38.6 
 
 		 455 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  38.72 
 
 		 462 aa  312  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  38.63 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  38.46 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  38.76 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  40.43 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  39.38 
 
 		 458 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  46.28 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  40.43 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  40.19 
 
 		 455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  39.38 
 
 		 458 aa  310  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  37.42 
 
 		 450 aa  309  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  38.9 
 
 		 442 aa  309  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  40.19 
 
 		 455 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  38.37 
 
 		 455 aa  308  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  37.05 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  39.52 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  37.08 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  38.19 
 
 		 467 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  41.54 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  38.22 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  36.83 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  40.53 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  37.27 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  36.91 
 
 		 464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  38.8 
 
 		 469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  36.91 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  36.91 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  38.21 
 
 		 452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  38.22 
 
 		 471 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  38.53 
 
 		 458 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  39.33 
 
 		 464 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  38.31 
 
 		 494 aa  299  7e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  39.33 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  39.5 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  38.39 
 
 		 463 aa  296  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  37.73 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  39.02 
 
 		 440 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  39.01 
 
 		 432 aa  292  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  39.3 
 
 		 478 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  38.53 
 
 		 453 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>