More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0991 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  100 
 
 
427 aa  887    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  45.15 
 
 
439 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  46.9 
 
 
404 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  45.61 
 
 
419 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  44.99 
 
 
403 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  43.49 
 
 
406 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  43.52 
 
 
411 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  46.48 
 
 
404 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  44.67 
 
 
412 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  43.25 
 
 
404 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  43.57 
 
 
408 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  43.84 
 
 
426 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  43.07 
 
 
407 aa  358  9e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  41.95 
 
 
410 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  44.13 
 
 
435 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  47.61 
 
 
430 aa  345  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  40.92 
 
 
412 aa  345  8.999999999999999e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  43.42 
 
 
405 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  40.74 
 
 
406 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  42.58 
 
 
409 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  41.28 
 
 
413 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  42.58 
 
 
409 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  44.88 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  40.59 
 
 
420 aa  339  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  38.96 
 
 
411 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  40.69 
 
 
422 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  38.77 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  38.77 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  38.77 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  38.77 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  38.77 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  38.77 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  38.77 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  38.77 
 
 
426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  39.8 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  39.01 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  37.92 
 
 
422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  38.77 
 
 
426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  38.33 
 
 
439 aa  305  7e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  38.52 
 
 
426 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  41.24 
 
 
411 aa  299  6e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  36.69 
 
 
422 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  36.69 
 
 
422 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  38.2 
 
 
428 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  37.99 
 
 
430 aa  293  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  37.95 
 
 
428 aa  291  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  42.4 
 
 
442 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  37.05 
 
 
440 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  40.57 
 
 
418 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  40.16 
 
 
471 aa  278  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  37.13 
 
 
433 aa  277  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  42.9 
 
 
411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  41.85 
 
 
783 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  38.19 
 
 
438 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  38.78 
 
 
440 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  36.45 
 
 
471 aa  269  8e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  36.57 
 
 
476 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  36.48 
 
 
447 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  35.78 
 
 
453 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  35.55 
 
 
453 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  35.43 
 
 
462 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  34.91 
 
 
462 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  36.13 
 
 
432 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  35.41 
 
 
454 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  37.88 
 
 
444 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  37.69 
 
 
453 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  35.41 
 
 
454 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  34.91 
 
 
442 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  35.93 
 
 
450 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  35.93 
 
 
454 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  35.93 
 
 
454 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  34.93 
 
 
453 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  35.84 
 
 
455 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  34.79 
 
 
471 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  35.93 
 
 
454 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  35.63 
 
 
494 aa  259  7e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  43.22 
 
 
548 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  35.84 
 
 
455 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  35.77 
 
 
455 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  35.84 
 
 
455 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  35.84 
 
 
455 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  34.66 
 
 
461 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  34.76 
 
 
464 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  34.76 
 
 
464 aa  257  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  34.76 
 
 
464 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  35.32 
 
 
463 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  35.59 
 
 
455 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  34.44 
 
 
458 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  37.25 
 
 
434 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  36.5 
 
 
452 aa  256  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  36.18 
 
 
455 aa  255  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  37.53 
 
 
464 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  36.39 
 
 
847 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  34.25 
 
 
458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  34.83 
 
 
465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  34.25 
 
 
458 aa  253  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  34.6 
 
 
453 aa  252  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  35.91 
 
 
458 aa  252  8.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  37.29 
 
 
464 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  34.96 
 
 
469 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>