More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1176 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  73.54 
 
 		 426 aa  650    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  87.91 
 
 		 422 aa  797    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  87.91 
 
 		 422 aa  797    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  72.49 
 
 		 422 aa  651    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  100 
 
 		 422 aa  882    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  73.79 
 
 		 426 aa  654    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  73.79 
 
 		 426 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  73.79 
 
 		 426 aa  654    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  73.79 
 
 		 426 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  73.79 
 
 		 426 aa  654    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  72.94 
 
 		 426 aa  663    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  73.79 
 
 		 426 aa  654    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  73.06 
 
 		 426 aa  651    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  73.79 
 
 		 426 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  73.54 
 
 		 426 aa  650    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  70.5 
 
 		 422 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  49.01 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  50 
 
 		 430 aa  411  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  47.52 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  46.15 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  47.55 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  45.74 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  47.04 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  45.59 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  44.61 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  45.72 
 
 		 409 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  45.72 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  43.95 
 
 		 405 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  43.5 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  44.01 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  43.24 
 
 		 411 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  43.14 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  42.36 
 
 		 404 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  40.39 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  40.89 
 
 		 404 aa  333  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  42.47 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  41.32 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  39.9 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  38.57 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  37.92 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  40.35 
 
 		 420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  38.33 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  39.85 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  38.08 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4499  peptidase U32  38.06 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  37.78 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  35.01 
 
 		 435 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  40.78 
 
 		 847 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  39.73 
 
 		 442 aa  256  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  39.34 
 
 		 810 aa  256  7e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  34.48 
 
 		 835 aa  252  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  34.52 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  37.2 
 
 		 848 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  38.32 
 
 		 862 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  35.05 
 
 		 440 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  34.63 
 
 		 432 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  36.94 
 
 		 886 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  32.46 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  40.15 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  35.52 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  32.46 
 
 		 458 aa  240  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  31.87 
 
 		 462 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  32.74 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  33.56 
 
 		 423 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  33.66 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  33.49 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  32.03 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  32.32 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  32.13 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  32.13 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  32.19 
 
 		 454 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  31.68 
 
 		 453 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  33.1 
 
 		 454 aa  232  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  31.83 
 
 		 455 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  40.32 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  32.84 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  30.97 
 
 		 471 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  31.89 
 
 		 455 aa  229  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  32.33 
 
 		 461 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  33.58 
 
 		 455 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  33.58 
 
 		 455 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  33.58 
 
 		 455 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  33.41 
 
 		 434 aa  229  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  33.58 
 
 		 455 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  32.39 
 
 		 455 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  34.12 
 
 		 452 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  32.78 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  33.99 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  30.89 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  34.88 
 
 		 494 aa  226  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  31.28 
 
 		 465 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  30.91 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  31.98 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  31.98 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  31.98 
 
 		 464 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  30.77 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  30.8 
 
 		 467 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  35.85 
 
 		 838 aa  226  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  32.52 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  37.34 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>