More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1004 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  71.93 
 
 		 453 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  71.93 
 
 		 453 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  71.93 
 
 		 453 aa  672    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  71.71 
 
 		 453 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  83.3 
 
 		 461 aa  815    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  71.71 
 
 		 453 aa  693    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  71.93 
 
 		 453 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  73.26 
 
 		 458 aa  694    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  68.11 
 
 		 463 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  71.93 
 
 		 453 aa  673    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  85.46 
 
 		 453 aa  818    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  86.59 
 
 		 455 aa  830    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  69.33 
 
 		 453 aa  660    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  71.93 
 
 		 453 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  71.93 
 
 		 453 aa  673    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  85.93 
 
 		 455 aa  826    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  85.71 
 
 		 455 aa  825    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  69.53 
 
 		 442 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  72.37 
 
 		 464 aa  704    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004387  putative protease  71.37 
 
 		 466 aa  679    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2466  peptidase  73.43 
 
 		 462 aa  696    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  73.05 
 
 		 450 aa  703    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  70.33 
 
 		 464 aa  646    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  71.71 
 
 		 453 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  70.04 
 
 		 453 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01024  protease  70.93 
 
 		 466 aa  677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  71.93 
 
 		 453 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  81.25 
 
 		 469 aa  799    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  70.9 
 
 		 462 aa  683    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  71.27 
 
 		 453 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  71.72 
 
 		 444 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  72.15 
 
 		 453 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  82.93 
 
 		 454 aa  810    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  71.87 
 
 		 458 aa  701    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  71.71 
 
 		 453 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  70.36 
 
 		 453 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  87.22 
 
 		 454 aa  842    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  86.37 
 
 		 455 aa  829    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0251  putative protease  70.93 
 
 		 466 aa  673    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  87.22 
 
 		 454 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  85.24 
 
 		 455 aa  818    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  72.37 
 
 		 464 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  79.87 
 
 		 454 aa  786    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  70.33 
 
 		 464 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  86.15 
 
 		 455 aa  827    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  85.93 
 
 		 455 aa  826    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  87 
 
 		 454 aa  839    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  72.37 
 
 		 464 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  71.71 
 
 		 453 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  73.13 
 
 		 453 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  100 
 
 		 465 aa  970    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  75.06 
 
 		 447 aa  728    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2206  U32 family peptidase  71.33 
 
 		 426 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  70.81 
 
 		 444 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4099  peptidase U32  68.93 
 
 		 435 aa  618  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  63.6 
 
 		 494 aa  609  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  64.07 
 
 		 471 aa  585  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  66.59 
 
 		 440 aa  586  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  64.6 
 
 		 476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  60.49 
 
 		 471 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  62.44 
 
 		 440 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  59.47 
 
 		 438 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  59.78 
 
 		 462 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  62.47 
 
 		 423 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  60.7 
 
 		 452 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  60.09 
 
 		 469 aa  551  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  57.71 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3962  peptidase U32  62 
 
 		 472 aa  542  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  57.49 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  60.66 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  58.84 
 
 		 478 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  57.87 
 
 		 435 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  59.25 
 
 		 432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  57.62 
 
 		 453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  56.76 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  54.4 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  39.91 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  40.64 
 
 		 406 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  39.69 
 
 		 405 aa  316  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  39.23 
 
 		 409 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  40.14 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  39 
 
 		 409 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  40.45 
 
 		 406 aa  310  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  41.21 
 
 		 420 aa  309  6.999999999999999e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  36.49 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  38.92 
 
 		 412 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  38.5 
 
 		 407 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  36.26 
 
 		 419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  39.27 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  39.46 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  39.52 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  37.03 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  37.91 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  37.99 
 
 		 408 aa  281  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  38.85 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  35.93 
 
 		 411 aa  272  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  38.85 
 
 		 412 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  35.12 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  37.84 
 
 		 410 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  37.26 
 
 		 420 aa  256  7e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>